Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Edn1P22387 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms