Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou5f1P20263 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.4 ms