Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RB1P06400 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RB1P06400 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RB1P06400 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RB1P06400 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RB1P06400 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RB1P06400 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RB1P06400 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RB1P06400 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RB1P06400 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RB1P06400 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RB1P06400 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RB1P06400 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RB1P06400 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RB1P06400 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RB1P06400 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RB1P06400 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RB1P06400 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RB1P06400 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RB1P06400 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RB1P06400 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RB1P06400 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RB1P06400 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RB1P06400 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RB1P06400 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RB1P06400 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RB1P06400 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RB1P06400 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RB1P06400 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RB1P06400 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RB1P06400 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RB1P06400 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms