Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01659 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01659 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01659 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01659 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01659 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01659 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01659 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01659 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01659 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01659 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms