Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP1P01033 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP1P01033 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMP1P01033 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms