Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB3O95704 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB3O95704 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB3O95704 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB3O95704 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBB3O95704 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBB3O95704 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBB3O95704 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBB3O95704 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBB3O95704 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBB3O95704 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms