Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sorl1O88307 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms