Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg2O55111 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms