Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brs3O54798 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Brs3O54798 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brs3O54798 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brs3O54798 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brs3O54798 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms