Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cited2O35740 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cited2O35740 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited2O35740 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cited2O35740 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms