Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r167G3UW71 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r167G3UW71 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms