Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptbn5F6UCX4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sptbn5F6UCX4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms