Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfta2E9PXB6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfta2E9PXB6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms