Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01553A4QN01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC01553A4QN01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01553A4QN01 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms