Protein–RNA interactions for Protein: A0PJN4

Ube2ql1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2Q-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2ql1A0PJN4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2ql1A0PJN4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2ql1A0PJN4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms