Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms