Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Defa20Q45VN2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms