Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf123Q5XPI3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf123Q5XPI3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms