Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CINP-202ENST00000536961 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 BX284668.1-202ENST00000422345 735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 FAM104B-203ENST00000425133 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC02184-201ENST00000568121 552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms