Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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