Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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