Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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