Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCND1Q9NSA2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms