Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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