Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms