Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 BLNK-204ENST00000427367 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC079988.1-201ENST00000432984 544 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL354809.1-201ENST00000618106 716 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 DANCR-205ENST00000623036 748 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC002094.5-201ENST00000623773 629 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms