Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RxrgP28705 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxrgP28705 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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