Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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