Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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Gm9955Q8CEJ8 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Gm9955Q8CEJ8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Gm9955Q8CEJ8 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Gm9955Q8CEJ8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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