Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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