Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms