Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms