Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERPINC1P01008 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms