Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms