Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SIX1Q15475 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SIX1Q15475 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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