Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL356273.1-201ENST00000441261 1152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ANKRD30BL-202ENST00000409867 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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