Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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