Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPCS3P61009 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms