Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Itgb8Q0VBD0 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Itgb8Q0VBD0 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Itgb8Q0VBD0 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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