Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APEX2Q9UBZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms