Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4eQ9R0Q8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4eQ9R0Q8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms