Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Trpc4Q9QUQ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Trpc4Q9QUQ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Trpc4Q9QUQ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4Q9QUQ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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