Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD4Q9NVD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD4Q9NVD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD4Q9NVD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms