Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITM2CQ9NQX7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITM2CQ9NQX7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms