Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLDQ9NQC7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYLDQ9NQC7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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