Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMMDC1Q9NPL8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms