Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CLSPNQ9HAW4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLSPNQ9HAW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms