Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTRAFQ9CQE8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms