Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab27bQ99P58 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms