Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arrdc1Q99KN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms